中国科学院遗传与发育生物学研究所(遗传发育所)成立于2001年，由原中国科学院遗传研究所、原发育生物学研究所及原石家庄农业现代化研究所整合而成。现有职工539人，其中科技人员403人。中国科学院院士3人（含兼职1人），研究员51人，副研究员、高级工程师和高级实验师 89人，国家杰出青年基金获得者16人，院'百人计划'与国外杰出青年引进人才24人，具博士学位的中青年学术带头人40人。设有遗传学和发育生物学专业硕士、博士学位点及博士后流动站。现有博士生导师49人，硕士生导师18人，在读博士生273人，硕士生176人，在站博士后16人。
遗传发育所以我国农业可持续发展重大战略需求为导向，重点开展生物技术育种与品种分子设计、基因组与生物信息、基因表达与调控、发育的分子基础、人类遗传多样性、转基因生物安全性和农田节水理论与节水技术创新等研究，建立以生物技术为核心的动植物品种设计的理论和技术体系，为我国农业生产提供新种质资源和优质、高产、抗逆新品种。
研究所下设4个研究中心(植物基因研究中心、发育生物学中心、人类与动物遗传学研究中心和农业资源研究中心)和2个支撑系统(农业高新技术试验示范基地和实验动物中心)。
目前承担国家、院省部级及国际合作项目课题183项。其中，国家高技术研究与发展项目(863计划)课题43项；国家重点基础研究发展规划项目(973项目)和子项目29项；国家植物转基因研究与产业化专项和课题18项；国家自然科学基金项目49项，其中重大项目2项；杰出青年基金10项；中国科学院创新重大项目及创新重要方向性项目37项；国际合作项目7项。
2004年度全所共发表学术论文194篇，其中SCI论文126篇，IF累计290；申请专利27项，授权28项(含美国专利1项)，审定农作物新品种4个，获国家科技进步二等奖1项。
遗传发育所是中国遗传学会的挂靠单位，负责编辑出版《遗传学报》、《遗传》和《中国生态农业学报》，中国遗传学会还主办了《激光生物学报》。本所还负责'国际植物组织培养与生物技术大会(IAPTC&B)'2003-2006年度会刊《In Vitro Cell-Dev Plant》(SCI)的编辑出版工作。