山东省医学科学院成立于1958年，是集科研、医疗、防治、教育、科技支撑管理与服务等职能于一体的综合性医学科研机构。下属13个单位、9所医院，以及承担医学人才培养任务的医学与生命科学学院、股份制事业单位山东省药物研究院。
全院在职职工4194人，其中专业技术人员3958人，具有副高以上职称的专业技术人员654人。90余人次获省部级以上荣誉称号或奖励。有：中国工程院院士2人，国家有突出贡献中青年专家1人，“万人计划”第一批百千万工程领军人才1人，新世纪百千万人才工程国家级人选1人，山东省优秀创新团队2个;博士生导师23人，硕士生导师218人。29位两院院士、43位海外专家担任院顾问或客座教授。
近年来，省医科院加快推动研、医、防、教等各项工作可持续发展，取得显著成效，综合实力和社会影响力大幅度提升。目前，全院有1个省部共建国家重点实验室培育基地、1个国家卫计委重点实验室、4个国家临床重点专科、1个国家中医药局重点实验室、1个国家中医药局重点学科、1个山东省重点建设的重点实验室、4个省重点实验室、4个省级示范工程技术研究中心、3个省级工程技术研究中心，1个省软科学研究基地，2个省工程实验室，为国家“化学中毒医疗救治基地”和国家“核辐射医疗救治基地”;另外还有10个省医药卫生重点实验室、15个省医药卫生重点学科。医学与生命科学学院拥有博士学位一级学科1个，硕士学位一级学科4个，二级学科39个，本科专业3个，具备结构完整的知识创新体系和人才培养体系。
1981年以来，先后承担各级科研项目3763项，其中国家级项目343项，省部级项目860项;获各类科技成果奖励1082项，包括国家科技进步一、二、三等奖14项，省部级科技奖项349项，一批具有国际水平的创新成果已经取得巨大的社会和经济效益。全院占地1556亩，其中在章丘明水开发区规划征地1000亩，建设院东部新区。截至2017年底，全院净资产总额35.21亿元、固定资产19.62亿元，综合实力位居全国医学科研院所前列。